昭和23年8月15日、山口県厚生農業協同組合連合会設立。県農業会の一部を本部事務所として発足し、その後数度の事務所移転を経て昭和33年11月25日、山口県農協会館の新築落成と同時に、現在の事務所へ移転しました。本部は、各事業部門の収支の状況はもとより、その時代の医療情勢を先取りして進路を見極めなければいけません。このような視点から、会の運営及び財務の企画（事業推進部企画管理課）、人材の確保と育成（総務部）など役職員一丸となって取り組んでいます。また、健康維持の増進のための保健予防活動やストレスチェックの実施及びメンタルヘルスの相談など保健事業活動（事業推進部健康管理課）も取り組んでいます。